美国哥伦比亚大学性学家朱迪・库里安斯基教授称：“年轻人对肛交的存在很多让人震惊的误区。他们觉得这不是(阴道)性交，因此就不会得病。”

　　实际上，肛交的风险比阴道性交高出很多倍，最大的问题是容易感染疾病，主要原因是直肠很容易吸收液体，以及肛交时容易给肛门的结构造成伤口。如果一方患有性病，例如感染了艾滋病病毒(HIV)、变形虫(阿米巴)、衣原体等，就很容易通过没有保护措施的肛交传染。即使戴上了安全套，肛交过程中也很容易破裂或者脱落而造成危险。广州市红十字会医院胃肠外科副主任医师刘少杰称，肛交还可传染梅毒、尖锐湿疣、软下疳等。

　　肛交特别容易感染人乳头瘤病毒(HPV)，研究发现这种病毒与肛管癌有关，尽管肛交并不直接导致癌症。美国弗莱德哈钦森癌症研究中心研究发现，反复进行肛交的人肛管癌发生率增加7倍。